《死亡空间1》是一部发生在未来世界的故事，故事背景设定在公元2508年。艾萨克·克拉克作为一名系统工程师，被派遣到一艘名为石村号的行星裂解舰上执行检修任务。这艘船有着悲惨的过去：它曾在神盾7号星球回收了一枚神秘的外星装置——神印（Marker 3A），结果导致船员们陷入集体幻觉，最终触发了一场灾难性的事件。
核心剧情如下：
一、登船调查
艾萨克和他的团队抵达石村号时，发现这艘巨大的舰船已经陷入了死寂，通讯中断，到处都是血迹。船员们因为接触了神印而陷入幻觉，他们变得疯狂，自残和暴力行为不断发生。更为恐怖的是，这些船员开始被异化为可怕的怪物——尸变体（Necromorphs），这些怪物是由死亡的生物重组而成的。艾萨克在求生的过程中了解到，神印能够通过电磁信号传播精神污染，诱导生物质融合为更高级形态，比如“血月”。
二、求生与真相揭露
艾萨克需要修复舰船系统，阻止异形入侵，同时寻找失踪的女友妮可。在寻找过程中，他发现妮可早已遇害，之前收到的求救视频只是神印制造的幻觉。神印的目的是利用艾萨克将神印送回神盾7号星球，以完成所谓的“聚合事件”。
三、最终抉择
艾萨克毅然摧毁了神盾7号星球，以阻断神印的信号，然后驾驶逃生舱离开了石村号。故事的结局暗示他仍然受到神印的幻觉困扰，他的精神可能已经被侵蚀。
关于故事的一些关键设定补充：神印实际上是外星文明遗留的装置，它能够操控有机生命体进行“进化”，但其真正目的是制造“血月”，吞噬宇宙生命。石村号的灾难直接源于人类的贪婪：人类无视神盾7号殖民地之前因研究神印引发的集体自杀事件，强行将神印运送到这艘船上的结果。整个故事的氛围通过封闭的太空船环境、碎片化的日志以及强烈的视觉冲击来构建，充满了压抑和恐怖。艾萨克的个人悲剧深化了对于人性与科技失控的反思。
